菌落計數器廣泛應用于食品和飲料的品質和衛生檢驗、乳制品行業、醫院、化妝品、制藥工業當中的微生物實驗室檢測等等，適用于對微生物的菌落計數和分析，能夠完成所有的菌落讀數類型，全自動菌落計數儀用戶操作界面簡潔、易用，菌落計數器是現代微生物檢測實驗室先進和的菌落計數器。
菌落計數器主要是作為判定食品被細菌污染程度的標記，菌落計數器也可以應用這一方法觀察食一中細菌的性質以及細菌在食品中繁殖的動態，以便對被檢樣品進行衛生學評價時提供科學依據。
1、菌落總數的測定：
是以檢樣中的細菌細胞和營養瓊脂混合后，每個細菌細胞都能形成一個可見的單獨菌落的假定為基礎的。由于檢驗中采用37于有氧條件下培養（空氣中含氧約20％），因而并不能測出每g或mL檢樣中實際的總活菌數，厭氧菌、微嗜氧菌和冷營菌在此條件下不生長，菌落計數器有特殊營養要求的一些細菌也受到了限制，因此所得結果，只包括一群能在普通營養瓊脂中發育、嗜中溫的、需氧和兼性厭氧的細菌菌落的總數。
2、鑒于食品檢樣中的細菌細胞是以單個，成雙、鏈狀、葡萄狀或成堆的形式存在，因而在營養瓊脂平板上出現的菌落可以來源于細胞塊，也可以來源于單個細胞，因此平板上所得需氧和兼性厭氧菌菌落的數字不應報告活菌數，而應以單位重量、容量或表面積內的菌落數或菌落形成單位數報告之。
菌落計數器特點：
1、彩色高清晰CCD攝像鏡頭，在硬件上保證了實驗數據結果的準確可靠。
2、開放式平臺設計，操作更方便、快捷。
3、底部LED雙光源下沉設計，可避免外界光線對開放平臺上的菌落影像干擾。
4、全自動菌落計數儀用戶操作界面友好、簡潔、易用，實驗人員可以快速上手、掌握實驗菌落計數操作。
5、快速讀取平板、螺旋、涂布、傾倒等菌落數，節省大量的人力和時間， 通過Smartcounter全自動菌落計數儀菌落智能識別技術，一秒內完成常規平皿計數。
6、菌落計數器采用加密U盾，有效保障數據庫管理和數據的安全。
7、可追蹤性：可保存每一次結果，節省空間，數據自動處理，儲存平板圖像，為監督檢測提供有效的法律依據
8、菌落計數器具有區分8種不同樣色菌落，大限度提高準確性；
9、人工修正：可人工添加、刪除菌落，對設備的統計結果進行修正。
10、可直接劃出去除區域，方便劃定平皿的刪除區域。
